目前，对再障的病因病机认识趋向于下述几个方面：

    外感热毒 此型起病急，发展快，病情变化迅速。热毒之邪燔灼津液，劫耗肾之真阴，同时邪热灼伤脉络，加速血行，甚至追血妄行，导致备种出血。若肾精耗伤乃至髓海枯竭，则可能导致脏腑功能衰竭，危及生命。              

    禀赋不足 主要有肾精不足和命门火衰两个方面：一是肾精不足，阴虚之体，相火妄动，扰精熬液，迫血妄行，髓海空虚，使气血再生发生障碍。水源将涸，肝木不荣，无以藏血则成肝血虚之症。但此肝血虚为标，肾阴虚为本。二是命门火衰。阳虚之体，温煦无权，、髓凝则无气血生发之机。再者，真火不旺，脾土即衰，运化无权，精微不化，以致赤血难生，临床虽可见脾肾阳虚之症，然而脾阳虚为标，肾阳虚为本。本病中阴虚和阳虚之间可相互影响，两者往往处于一种相互转换的动态中。

    血瘀内生 再障病势日久缠绵，脏腑虚衰，气不帅血，血行不畅，形成瘀血；阴虚火旺，炼津熬血，致血凝成瘀；邪热迫血妄行，络破成瘀；或真火式微，血寒而涩，流行不利而成瘀。瘀血既是病理产物，同时又是新的致病因素，形成病理上的恶性循环。