1、重大传染病方面，从总体情况看，我国传染病患病人数仍居世界高位。结核病、肝炎等传统传染病，艾滋病、非典、人禽流感等新发传染病严重威胁着人民 健康。
我国是世界上22个结核病高负担国家之一，结核病患者数量居世界第二位，80%的病人在农村，每年死亡13万人。目前，我国绝大部分省份实行了不同经费来源的结核
病控制项目，对传染性肺结核病人进行免费检查和免费抗结核药物治疗。
乙型肝炎在中国广泛流行。据调查推算，全国约有1亿人长期携带乙肝病毒，慢性乙肝病人约2000万，每年约有28万人死于与乙肝病毒感染相关的肝硬化或肝癌。自2002年起，政府补助为所有新生儿免费接种乙型肝炎疫苗。
最新疫情评估结果显示，截至2005年年底，中国现有艾滋病病毒感染者和病人约65万人。我国将艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治列入“十一五”国家重大科技专项，2006年国务院发布《艾滋病防治条例》，艾滋病防治“四免一关怀”政策纳入法制化轨道。
2006年，有散在的人禽流感新发病例，没有新发的非典病例。全国传染病疫情和突发公共卫生事件信息网络体系建设成效显著，建立了人感染禽流感等新发传染病的防控工作体系。
2、慢性病方面，2006年5月卫生部 疾病预防控制局和中国疾控中心联合发布的《中国慢性病报告》表明，中国慢性病死亡人数占总死亡人数的比例已由1991年的70%上升到2000年的近81%，城市和农村慢性病死亡人数占总死亡人数的比例高达约85%和80%。
绝大部分慢性病可以通过控制危险因素进行预防。其中最主要的三个因素是：不 健康饮食，不锻炼身体和使用烟草。卫生部门制定了防控 高血压、恶性 肿瘤、糖尿病等慢性 疾病的工作指南及行动规划，并将加强 健康教育和行为干预，积极探索有效的预防和治疗措施。
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